Mutlu, 26 Temmuz'da Üsküdar Salacak'taki evinde yapılan arama sonrasında gözaltına alınmıştı. 31 Mayıs 2010'da İstanbul Valiliği'ne atanan Mutlu, 15 Eylül 2014 Valiler Kararnamesi ile merkez valiliğine atanmıştı.
Mutlu, FETÖ'nün 15 Temmuz darbe girişiminin ardından İçişleri Bakanlığı tarafından görevden uzaklaştırılan 246 mülki amir arasında yer alıyordu.
Soruşturma kapsamında, İstanbul Emniyet Müdürlüğü Mali Suçlarla Mücadele Şube Müdürlüğü ekiplerince gözaltına alınan eski İstanbul Valisi Hüseyin Avni Mutlu'nun da aralarında bulunduğu 6 vali, 1 vali yardımcısı, 3 kaymakamın emniyetteki işlemleri tamamlandı.